تأسس هذا القسم في العام الجامعي 1993/1994. يضم القسم سبعة أعضاء هيئة تدريس في مجالات الخضراوات، المحاصيل العلفية، التربة، أمراض النبات والحشرات. ويمتاز القسم بالربط بين تخصصي الإنتاج النباتي والوقاية وذلك بطرح مساقات من كلا التخصصين، حيث يدرس الطالب مساقات مختلفة في مجالات الإنتاج النباتي منها إكثار النبات، الخضراوات، تحسين النبات، المحاصيل العلفية، الوراثة، فسيولوجيا النبات، التقنيات الحيوية في النبات، والزراعة العضوية. أما في مجال الوقاية فيدرس الطالب مساقات متعددة منها علم الأمراض النباتية، علم الحشرات، أمراض المحاصيل، حشرات المحاصيل، المبيدات والمكافحة المتكاملة.